À la fin de la période de formation, le directeur de thèse et le doctorant remettent chacun au responsable du suivi des thèses un rapport sur la période de formation ; ils indiquent en particulier, chacun en ce qui les concerne, leur perception du déroulement de la thèse.
Est joint à ce rapport un descriptif recensant les acquis des formations complémentaires suivies par le doctorant, ainsi que ses compétences techniques acquises durant la formation doctorale.
Le directeur de l'unité d'accueil, le parrain éventuel et l'employeur peuvent également rédiger un rapport sur la période de formation. En outre, le doctorant peut demander la rédaction d'un rapport sur la période de formation à toute personne qu'il estime capable, de par sa position, d'apprécier le déroulement général de la thèse.
Tous ces documents sont également joints au rapport.